El departamento de Amazonas está constituido por regiones de Sierra y Selva, predominando la zona selvática (72.93%) que se extiende hacia el norte, hasta la frontera con el Ecuador en la cumbres de la del Cóndor, por su vientre oriental. La zona de la sierra solo abarca el 27,07% del total de la superficie territorial del departamento.
Uno de los factores que contribuyen a dar gran importancia a su geografía es no solo es que los grandes valles y planicies de su zona selvática son los más próximos al océano Pacífico, sino que sus conexiones con las rutas de la costa son las más bajas porque utilizan el paso de Porculla, que se encuentran a solo 2144 msnm, siendo el paso más bajo de toda la cordillera de los Andes Del Perú para llegar al sistema vial panamericano.